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                             analysis and application in Nicotiana

 

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1.GAN数据库的全面介绍,包括GAN各个部分的链接,一些参考文献,以及各种联系方式等信息

 


GERMPLASM top

 

 

1.通过模糊搜索进行烟草种质的查询

2.搜索所有的烟草种质

3.通过烟草种质的名称,ID和国际编码进行查询

4.通过35个烟草种进行烟草种质的查询

5.通过7种不同的烟草类型进行查询,包括白肋烟,烤烟,晒烟,黄花烟,野生烟,雪茄和香料烟

6.通过不同的45个国家进行烟草种质的查询

7.通过35个不同的烟草农艺性状进行查询

8.通过烟草不同种质对于7种烟草病害的抗性情况进行查询

9.用户搜索的结果

10.每个种质的详细信息展示

 


GENOMICS top

 

 

 

1.通过从公共数据平台NCBI和SOL茄科数据库下载到各个烟草远数据;各个烟草测序的基本信息表

2.Nicotiana sylvestris,Nicotiana tomentosiformis,Nicotiana otophora,Nicotiana tabacum BX,Nicotiana tabacum K326 and Nicotiana tabacum TN90 的详细信息的表格展示

 


GENETICS top

 

 

1.10张烟草遗传连锁图谱的基因信息以及查询和展示

2.烟草基因的基因家族的信息的查询和展示

3.烟草基因的注释信息的查询和展示

4.普通烟草和番茄和马铃薯的共线性分析图

5.一个序列查询的小工具

 


MARKERS top

 

 

1.通过不同的烟草种,SSR的类型以及SSR的ID进行SSR及其引物的查询

2.通过不同的SNP名称,基因ID和变异的碱基进行SNP的查询

3.通过PIP的ID,基因的名称和PlantGDB的ID进行PIP标记的查询

4.通过基因ID和不同烟草种进行RT-PCR的查询

 


JBROWSE top

 

 

1.Jbrowse基因组浏览器提供了一个图形化的展示,包括基因组的序列信息,各类分子标记的详细信息,并且提供了各类信息的下载

 


TOOLS top

 

 

1.与7个烟草基因组的在线Blast工具

2.利用MISAPerl软件包进行的SSR扫描工具

3.将核苷酸序列转化成氨基酸序列的在线工具

4.在线引物设计工具

5.电子模拟PCR验证工具

 


DOWNLOAD top

 

 

1.本平台中所有的数据集都可以在本页面中进行查找和下载


STATISTICStop

 

 

1.在本平台上对于原始数据和我们分析所得的数据进行的一系列统计和分析


FEEDBACK top

 

 

1.用户可以通过本页面给我们的工作反馈意见和建议


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1.本研究室的一些详细信息

 

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