An analysis of the STRs

Chromosome
All
Single
2
3
4
5
6
7
1AL 68785 969 10957 8330 1958 303 3298 42970
1AS 37590 933 5545 4266 1067 204 1517 24058
1BL 62174 661 9941 6594 1682 329 2417 40550
1BS 47520 1350 7327 5305 1374 259 1850 30055
1DL 49826 543 7340 4923 1383 286 2129 33222
1DS 27573 662 3523 3311 834 156 1320 17767
2AL 69887 1393 10407 7586 2172 427 3191 44711
2AS 52342 352 8257 5709 1509 281 2215 34019
2BL 91358 1582 13338 10234 2708 506 3581 59409
2BS 63575 1330 9283 7101 1841 341 2573 41106
2DL 63101 3598 9345 6167 2116 451 2742 38682
2DS 38250 886 5768 4124 1221 230 1886 24135
3AL 47653 384 7575 4553 1413 230 2099 31399
3AS 38198 255 6056 4075 1030 184 1704 24894
3B 140914 2080 22243 15491 4068 798 5481 90753
3DL 41807 2068 6314 3397 1256 298 1749 26725
3DS 30386 735 4709 2746 829 129 1225 20013
4AL 75652 1630 10632 8520 2475 473 3191 48731
4AS 58350 1106 9089 6343 1495 286 2515 37516
4BL 56121 3153 8274 5662 1629 311 2217 34875
4BS 64912 1006 10298 6830 1808 351 2615 42004
4DL 61249 3482 8552 7457 2038 396 3207 36117
4DS 29767 553 4094 3480 881 146 1465 19148
5AL 60931 611 9865 6094 2013 425 2841 39082
5AS 37438 350 6445 3949 975 152 1701 23866
5BL 91037 1706 12846 10563 2735 613 3728 58846
5BS 36353 756 5174 4397 922 198 1543 23363
5DL 53176 845 7626 5517 1824 351 2652 34361
5DS 31693 611 4375 3703 1036 145 1435 20388
6AL 46507 978 7431 5117 1345 288 2054 29294
6AS 46800 761 7107 5442 1261 190 2148 29891
6BL 55218 720 9399 5511 1376 300 2095 35817
6BS 45357 436 7998 4401 1131 244 1677 29470
6DL 42258 596 6292 4665 1383 232 2057 27033
6DS 31772 507 4768 3438 944 136 1472 20507
7AL 52295 694 9086 5110 1636 274 2464 33031
7AS 44764 2648 7178 4213 1363 246 1853 27263
7BL 62854 4356 10298 5677 1823 332 2346 38022
7BS 44326 577 7471 4307 1097 199 1707 28968
7DL 48333 803 6927 5254 1563 285 2254 31247
7DS 45949 696 6958 4717 1372 351 2033 29822
bre 8249 14 22 4258 29 5 1183 2738
whA 5540 99 49 1990 83 18 746 2555
whD 7821 123 156 2683 157 33 999 3670

The composotion of the TNRs in the China Spring


SSR markers designed in this database

Chromosome 1AL 1AS 1BL 1BS 1DL 1DS 2AL 2AS 2BL 2BS 2DL 2DS
Primers 35250 23446 41606 29821 32498 16755 45558 35165 59647 41119 35964 23992
Aimd Primer 19402 12899 20944 16224 16009 8870 24959 20203 33785 22901 19654 12614
Chromosome 3AL 3AS 3B 3DL 3DS 4AL 4AS 4BL 4BS 4DL 4DS
Primers 32841 26767 92191 25162 17955 48552 37607 34884 42878 32021 19155
Aimd Primer 18684 13298 57306 14399 9214 26530 16835 16563 20755 18208 10236
Chromosome 5AL 5AS 5BL 5BS 5DL 5DS 6AL 6AS 6BL 6BS 6DL 6DS
Primers 40031 25512 58920 23503 35753 19397 30276 30499 37155 30438 28317 21509
Aimd Primer 22013 11881 33886 11924 20786 10639 17521 17271 21630 15759 14716 11078
Chromosome 7AL 7AS 7BL 7BS 7DL 7DS
Primers 34772 27953 37881 30032 30980 30381
Aimd Primer 19003 15880 22723 16281 18020 17669

EST-SSRs amplification on the China Spring genome


SSRs and markers abundance in on the genome